Publications and dissemination activities

DN17/6 2017 A New Approach, Based on an Intercriteria Data Analysis, to Support Decision Making in in silico Studies of Complex Biomolecular Systems

СПИСЪК НА ДЕЙНОСТИТЕ ПО РАЗПРОСТРАНЕНИЕ (ДР) НА РЕЗУЛТАТИТЕ по проект ДН 17/6, финансиран от Фонд „Научни изследвания“ на тема „Нов подход, базиран на интеркритериален анализ на данни, за подпомагане на вземане на решения при in silico изследване на комплексни биомолекулни системи“

ДР 1. Подготвяне и публикуване на научни статии, отразяващи получените резултати
Научни публикации по проекта (публикувани, или приети за печат)

  • в списания с импакт фактор (ИФ)
  1. Lagarde N., E. Goldwaser, T. Pencheva, D. Jereva, I. Pajeva, J. Rey, P. Tuffery, B. O. Villoutreix, M. A. Miteva, A Free Web-based Protocol to Assist Structure-based Virtual Screening Experiments, International Journal of Molecular Sciences (special issue Recent Advances in Virtual Screening), 2019, 20(18), 4648, IF (2018) 4.183, https://www.mdpi.com/journal/ijms.
  • в списания с импакт ранг (ИР)
  1. Atanassov K., Index Matrices with Elements Index Matrices, Proceedings of the Jangjeon Mathematical Society, 2018, 21(2), 221-228, SJR 0.208, http://jangjeonopen.or.kr/PJMS/journal.php.
  2. Atanassov K., n-Dimensional Extended Index Matrices. Part 1, Advanced Studies in Contemporary Mathematics, 2018, 28(2), 245-259, SJR 0.284, http://jangjeonopen.or.kr/ASCM/journal.php.
  3. Tsakovska I., P. Alov, N. Ikonomov, V. Atanassova, P. Vassilev, O. Roeva, D. Jereva, K. Atanassov, I. Pajeva, T. Pencheva, InterCriteria Analysis Implementation for Exploration of the Performance of Various Docking Scoring Functions, accepted in Studies in Computational Intelligence, 2019, in press, SJR (2018) 0.183, https://www.springer.com/series/7092.
  4. Atanassov K, V. Bureva, Four Operations over Extended Intuitionistic Fuzzy Index Matrices and Some of Their Applications, accepted in Studies in Computational Intelligence, 2019, in press, SJR (2018) 0.183, https://www.springer.com/series/7092.
  5. Pajeva I., I. Tsakovska, T. Pencheva, P. Alov, M. Al Sharif, I. Lesigiarska, D. Jereva, A. Diukendjieva, In silico Studies of Biоlogically Active Molecules, accepted in Studies in Computational Intelligence, 2019, in press, SJR (2018) 0.183, https://www.springer.com/series/7092.
  6. Jereva D., T. Pencheva, I. Tsakovska, P. Alov, I. Pajeva, Exploring Applicability of InterCriteria Analysis to Evaluate the Performance of MOE and GOLD Scoring Functions, accepted in Studies in Computational Intelligence, 2019, SJR (2018) 0.183, https://www.springer.com/series/7092.

 Научни публикации по проекта, подадени в реферирани и индексирани научни списания:

  1. Atanassov K., T. Pencheva, Cartesian Products over Intuitionistic Fuzzy Index Matrices, submitted to Proceedings of the Jangjeon Mathematical Society, 2019, SJR (2018) 0.208, http://jangjeonopen.or.kr/PJMS/journal.php.

ДР 2. Представяне на резултатите от изследванията, проведени в рамките на проекта, пред научни форуми в България и в чужбина, както и при посещения в други изследователски звена.

  1. Tsakovska I., P. Alov, T. Pencheva, D. Jereva, V. Atanassova, P. Vassilev, N. Ikonomov, K. Atanassov, I. Pajeva, Structure-based Modelling Study of PPARgamma Ligands: Exploring the Performance of Various Docking Scoring Functions, 5th International Conference on Computation for Science and Technology (ICCST 2018), September 23-26, 2018, Antalya, Turkey, Book of Abstracts, p. 63.
  2. Pencheva T., D. Jereva, I. Tsakovska, P. Alov, P. Vassilev, N. Ikonomov, K. Atanassov, I. Pajeva, Exploring the Performance of MOE Scoring Functions on a Set of Benzamidine-type Inhibitors Using InterCriteria Analysis, 5th International Conference on Computation for Science and Technology (ICCST 2018), September 23-26, 2018, Antalya, Turkey, Book of Abstracts, p. 71.
  3. Pencheva T., InterCriteria Analysis and Its Application To Support Decision Making in in silico Studies of Biomolecular Systems, Mathematics of Biological Rhythms Workshop, December 3-5, 2018, Newcastle upon Tyne, UK, Book of Abstracts, p. 16, invited lecture.
  4. Jereva D., T. Pencheva, I. Tsakovska, P. Alov, I. Pajeva, Exploring Appicability of InterCriteria Analysis on the Performance of MOE and GOLD Scoring Functions, 13th Annual Meeting of the Bulgarian Section of SIAM (BGSIAM’18), December 18-20, 2018, Sofia, Bulgaria, Book of Abstracts, p. 56.
  5. Angelova M., T. Pencheva, D. Jereva, I. Tsakovska, P. Alov, I. Pajeva, Multicriteria Analysis for Decision-making in Docking Studies: Performance of Scoring Functions in Free Software Packages, 10th International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources (CMTPI-2019), Ioannina, Greece, June 23-27, 2019, Book of Abstracts, p. 65.
  6. Jereva D., T. Pencheva, I. Tsakovska, P. Alov, I. Pajeva, On the Applicability of InterCriteria Analysis to the Performance of Scoring Functions in Molecular Modelling Software Packages, 10th International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources (CMTPI-2019), Ioannina, Greece, June 23-27, 2019, Book of Abstracts, p. 38.
  7. Atanassov K., V. Bureva, Four Operations over Extended Intuitionistic Fuzzy Index Matrices and Some of Their Applications, High Performance Computing, September 2-6, 2019, Borovets, Bulgaria, Book of Abstracts, p. 17.
  8. Tsakovska I., P. Alov, N. Ikonomov, V. Atanassova, P. Vassilev, O. Roeva, D. Jereva, I. Pajeva, K. Atanassov, T. Pencheva, InterCriteria Analysis Implementation for Exploration of the Performance of Various Docking Scoring Functions, High Performance Computing, September 2-6, 2019, Borovets, Bulgaria, Book of Abstracts, p. 18.
  9. Pencheva T., S. Ribagin, K. Atanassov, On Application of Generalized Nets Theory and InterCriteria Analysis Approach to Biomedical Studies, 2019 AMSI Workshop Dynamical Systems in Physiology, September 6-7, 2019, Melbourne, Australia, Book of Abstracts, p. 8.
  10. Pencheva T., M. Angelova, D. Jereva, I. Tsakovska, P. Alov, V. Atanassova, I. Pajeva, On the Applicability of InterCriteria Analysis Approach to the Performance of AMMOS2 Software Platform for Post-docking Optimization, Asian Federation for Medicinal Chemistry (AFMC) 12th International Symposium “New Avenues for Design and Development of Translational Medicine” (AIMECS 2019), Istanbul, Turkey, September 8-11, 2019, Abstract Book, p. 153.
  11. Pencheva T., On Application of InterCriteria Analysis Approach to Support Decision Making in Biomedical Informatics, Mathematics of Physiological Rhythms, September 9-13, 2019, Creswick, Australia, Keynote Abstracts, p. 6.
  12. Jereva D., T. Pencheva, M. Angelova, I. Tsakovska, P. Alov, I. Pajeva, Exploring the Performance of Different Scoring Functions in Commercial, Open Source and Free Software Packages for Molecular Docking via InterCriteria Analysis Approach, Humboldt Kolleg “Science without Borders: Alexander von Humboldt’s Concept in Today’s World”, September 18-21, 2019, Varna, Bulgaria, Book of Abstracts, p. 37-38.

ДР 3. Представяне на подхода на интеркритериален анализ и на резултати от изследванията по проекта в лекции пред студенти и докторанти.

  1. Март 2018 г. – лекционен курс по „Системи с интелигентно поведение“ в магистърска програма „Компютърни системи и технологии“ в Университет „Проф. д-р Асен Златаров“ – Бургас.
  2. Април 2018 г. – лекционен курс по „Изкуствен интелект“ в бакалавърска програма за редовни и задочни студенти по „Компютърни системи и технологии“ в Университет „Проф. д-р Асен Златаров“ – Бургас.
  3. Октомври, 2018 – януари, 2019 г. – лекционен курс по „QSAR и молекулно моделиране“ в магистърска програма „Tеоретична химия“ в Софийски Университет „Св. Кл. Охридски“.
  4. Септември-ноември 2018 г. – лекционен курс по „Изкуствен интелект“ в бакалавърска програма за редовни и задочни студенти по „Компютърни системи и технологии“ в Университет „Проф. д-р Асен Златаров“ – Бургас.
  5. Ноември 2018 г. – лекционен курс по „Системи с интелигентно поведение“ в магистърска програма „Компютърни системи и технологии“ в Университет
    „Проф. д-р Асен Златаров“ – Бургас.
  6. Ноември-декември 2018 г. – лекционен курс по „Размити множества“ в магистърска програма „Компютърни системи и технологии“ в Университет „Проф. д-р Асен Златаров“ – Бургас.
  7. Март 2019 г. – лекционен курс по „Изкуствен интелект“ в бакалавърска програма за редовни и задочни студенти по „Компютърни системи и технологии“ в Университет „Проф. д-р Асен Златаров“ – Бургас.
  8. Април 2019 г. – лекционен курс по „Размити множества“ в магистърска програма „Компютърни системи и технологии“ в Университет „Проф. д-р Асен Златаров“ – Бургас.
  9. Април 2019 г. – лекционен курс по „Системи с интелигентно поведение“ в магистърска програма „Компютърни системи и технологии“ в Университет
    „Проф. д-р Асен Златаров“ – Бургас.
  10. Септември 2019 г. – лекционен курс по „Изкуствен интелект“ в бакалавърска програма за задочни студенти по „Компютърни системи и технологии“ в Университет „Проф. д-р Асен Златаров“ – Бургас.

ДР 4. Разработване и поддръжка на интернет страница на проекта.

Разработена е и се поддържа интернет страница на проекта:

Други:

  1. 21.06.2018 г. – Представяне на подхода на ИКрА пред представители на E*HealthLine.com, Inc, Sacramento, California
  2. 10.07.2018 г. – Работна среща на колектива на проекта с поканени гости от Факултета по химия и фармация на СУ „Св. Климент Охридски“: Подход на ИКрА – състояние, доразвитие.
  3. 28.09.2018 г. – Дискусия на получените до момента резултати от приложението на ИКрА при in silico изследване на комплексни биомолекулни системи с членовете на Международния консултантски съвет проф. Януш Кацпржик и проф. Еулалия Шмидт от Институт по системни изследвания към Полска академия на науките при посещение на членове на колектива във Варшава, Полша.
  4. 18.03.2019 г. – Дискусия на получените до момента резултати от приложението на ИКрА при in silico изследване на комплексни биомолекулни системи с члена на Международния консултантски съвет д-р Мария Митева от INSERM, Университет “Paris Diderot”, при посещение на членове на колектива в Париж, Франция.
  5. 04.07.2019 г. – представяне на проекта в „Седмица на бенефициентите на ФНИ“, организирана от ФНИ.

DFNI-I-02-5 “InterCriteria Analysis – A New Approach to Decision Making”

Pre-project publications

Project publications

Comments are closed.